La rumeur court depuis plusieurs années que la compagnie El Al avait équipé ses avions de ligne de systèmes anti-missiles. Les autorités israëliennes n'ont jamais confirmé ni démenti. Aujourd'hui un document confidentiel transmis par les services de sécurité américains fait état d’une demande des autorités US pour équiper les avions à destination ou en provenance du moyen orient de contre mesure anti missiles visant à détourner des attaques au décollage ou l’atterrissage.
Selon les spécialistes, El Al aurait équipé ses appareils de systèmes sophistiqués permettant de détecter le tir éventuel de missiles. En complément, la compagnie aurait formé ses pilotes (souvent issus du monde militaire) à engager les mesures de protection via des contre missiles armées depuis le cockpit de l’appareil. Le système et son principe même n'ont jamais été confirmés mais la compagnie semble malgré tout faire école, et un devis a même été établi : le coût d’implantation du système dépasserait le 1 million de dollars/appareil. Pour les USA, seules 15 destinations sensibles sont concernées : outre Israël, il s'agit des liaisons vers Beyrouth, la Syrie et l’Afrique de l’Est.
