Craignant un cas d'Ebola, la procédure d'urgence a été appliquée. L'avion d'Air France a été isolé sur la piste à son arrivée et les médecins du Service médical d'urgences (SMU) de Roissy sont intervenus. L'examen du malade a montré qu'il s'agissait d'une fausse alerte. «Le doute a rapidement été levé et le jeune patient a été pris en charge par les équipes de Service médical d'urgence à son arrivée à Roissy», a expliqué le Dr Feuillie, responsable de la médecine passagers de la compagnie au Parisien. Il semblerait que le voyageur souffrait en fait d'une gastro-entérite. Françoise Weber, directrice adjointe de la santé, au ministère de la Santé, a précisé que «Une personne ayant de la fièvre et des symptômes a été signalé vers 4 heures du matin, en cours de vol. Il y a eu échanges d’informations entre l’équipage, le Samu, et l’Institut de veille sanitaire pour évaluer le cas. A l’arrivée, cette personne a été "exclue" des cas possibles Ebola car elle n’en présentait pas les symptômes».
Contrairement à plusieurs concurrents, Air France continue d'assurer ses liaisons vers les pays touchés par la maladie. Ce choix inquiète certains salariés du transporteur français, ils ont lancé une pétition afin de suspendre ces dessertes.