Ces communautés de communes et d’agglomération de trois départements (Ain, Isère, Rhône) estiment avoir toutes la compétence en termes de transport et de développement économique légitimant leur démarche. Elles souhaitent que la 3ème gare de l’agglomération lyonnaise réponde aux attentes de leurs habitants en termes d’offres et de services mais également aux 3 500 entreprises implantées dans la région, qui emploient plus de 100 500 personnes. Les communautés, qui ont également transmis leurs vœux au Secrétaire d'Etat chargé des Transports Dominique Bussereau, avancent aussi un argument écologique, estimant que «Les habitants et entreprises de ce territoire émettent plus de CO2 en se rendant à Lyon-Part Dieu plutôt qu’à Lyon-Saint Exupéry du fait de la distance et de la congestion de la circulation».
Le document transmis à la direction de la SNCF indique qu’à l’horizon 2020, des TER pourraient utiliser la gare de Lyon-Saint Exupéry grâce à des infrastructures voyageurs dédiées. Des services entre Saint-Etienne et Grenoble via Lyon-Saint Exupéry et entre Saint- Etienne et Bourg via Lyon-Saint Exupéry pourraient être proposés pour faciliter d’une part les déplacements pendulaires domicile-travail et d’autre part les correspondances pour les TGV à Lyon-Saint Exupéry.