Les voyageurs d'affaires munis d'un billet Blue devront payer 25 dollars pour faire enregistrer leur bagage. Il ne leur sera demandé que 20 dollars s'ils achètent ce service par le biais du site de JetBlue ou à une borne. Chaque valise mise en soute supplémentaire est au prix de 35 dollars. En revanche, le bagage cabine et le petit sac personnel restent gratuits avec cette offre.
Les bagages enregistrés sont toujours inclus avec les tarifs Blue Plus (1 bagage en soute), Blue Flex (2) et Mint (2).