Auparavant chez Air France-KLM, il travaillera aux côtés de Cédric Renard, directeur général France de la compagnie de Dubaï, et de Bertrand Flory, directeur des ventes France.
Jean-Joseph Boidot a fait toute sa carrière dans le transport aérien. À la suite de son Master en “Systèmes d’Information, spécialité Ingénierie Financière” à l’ECE, il a d'abord été consultant dans le cabinet de conseil Ariane Strategy Consulting. Il a ensuite rejoint Air France-KLM, en tant que Pricing Manager en charge de la région Moyen-Orient et Golfe (2014-2017), puis en tant que Price Manager Retail et Projets (2017-2020) avant de travailler sur un poste à dominante commerciale en tant que Responsable des Ventes Agences en Ligne pour le Marché France, poste qu’il occupait jusqu’à son arrivée chez Emirates France.