La compagnie aérienne fait office de mauvaise élève en matière de perte de bagages. Selon les données publiées par le Département Américain des Transports, elle arrive en dernière position des 10 plus grandes compagnies américaines.
En juin 2019, la compagnie aérienne a perdu 11 sacs pour 1 000 passagers, soit la moyenne la plus basse parmi les 10 plus grandes compagnies aériennes américaines. Un problème majeur dont le taux augmente à Philadelphie, plaque tournante d'American Airlines (70% du trafic de l'aéroport) avec 20 sacs égarés pour 1 000 personnes embarquées en juin 2019.