A l'aéroport de Lyon Saint-Exupéry, le trafic des vols commerciaux reprend progressivement avec des mesures d'hygiène renforcées.
Pour Air France, une partie des vols reprendront dès le 8 juin vers Nantes, Bordeaux et Toulouse, puis vers Paris CDG le 9 juin suivi des vols vers Biarritz, Caen, Lille, Nice, Rennes, Brest et Strasbourg le lundi 15 juin et enfin, Pau dès le lundi 22. Du côté de Bruxelles Airlines, la capitale belge sera reliée à raison de 5 fois par semaine à Lyon dès le 22 juin puis 7 fois par semaine du 29 juin au 5 septembre 2020.